维如咨询基于客户调研，专家访谈，文献研究等整理出落地实施卓越运营所面临三个维度的典型挑战，即思维、能力、治理
专注卓越运营研究的机构BTOES(Business Transformation & Operational Excellence World Summit )2021年发布了一份研究报告，数据显示53.1%的受访者表示改变和改善公司文化是卓越运营所面临的最大的也是最关键的挑战。
落地卓越运运营管理体系的另一个挑战是如何为组织配置资源并培养掌握卓越运营管理工具的人才。麦肯锡的研究表明精益运营和六西格玛质量管理项目为全球企业广泛使用，往往能使不同行业生产力提升10%至60%。但由于实施方式不正确，效果极为有限。企业往往更关注技术工具，却鲜有关注人力因素，比如帮助员工适应并熟悉新流程。
治理在这里指的是为了推行卓越运营如何给予足够的资源和授权。在实际的工作中，导致卓越运营管理推不动的原因是资源和授权不够。无论是丰田的丰田章男，还是华为的任正非、以及丹纳赫的董事长和CEO，他们都是亲自宣传甚至实践其卓越运营管理体系
